In der Sitzung des Gesamtgerichts vom 5. Juli 2011 hat das Bundesstrafgericht eine Anpassung der Organisationsstruktur beschlossen. Das Gericht besteht neu aus zwei Kammern, der Beschwerdekammer, die sowohl Beschwerden in Strafsachen als auch im Bereich der internationalen Rechtshilfe in Strafsachen beurteilt, und der Strafkammer. Anlässlich der Sitzungen des Gesamtgerichts vom 23. bzw. 30 August 2011 sind zudem die Kammern neu bestellt worden. Die Kammerbesetzung ist ab 1. Januar 2012 wie folgt:

Beschwerdekammer
Stephan Blättler (Kammerpräsident)
Andreas J. Keller
Emanuel Hochstrasser (Doppelzuteilung)
Tito Ponti
Giorgio Bomio Giovanascini
Roy Garré
Cornelia Cova
Patrick Robert-Nicoud
Nathalie Zufferey Franciolli

Strafkammer
Giuseppe Muschietti (Kammerpräsident)
Peter Popp
Walter Wüthrich
Emanuel Hochstrasser (Doppelzuteilung)
Sylvia Frei-Hasler
Daniel Kipfer Fasciati
Miriam Forni
Jean-Luc Bacher
Joséphine Contu
David Glassey

Die Vereinigte Bundesversammlung hat Andreas J. Keller als Präsidenten des Gesamtgerichtes sowie den Vizepräsidenten Daniel Kipfer Fasciati am 28. September 2011 wieder gewählt. Roy Garré ist als drittes Mitglied der Verwaltungskommission bereits am 30. August 2011 vom Gesamtgericht bestätigt worden.